Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms