Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNAQ96QF7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNAQ96QF7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms