Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms