Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms