Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms