Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms