Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms