Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNRIP1Q96F85 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms