Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGF29Q96ES7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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