Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPACA9Q96E40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms