Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms