Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms