Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms