Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113Q902F9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113Q902F9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms