Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL22A1Q8NFW1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms