Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIEQ8NEW7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms