Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
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