Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC63Q8NA47 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms