Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8AQ86V59 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms