Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXIP1Q6ZW49 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms