Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms