Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms