Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms