Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms