Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms