Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms