Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPPQ6IPU0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms