Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYW3Q6IPR3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms