Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BROXQ5VW32 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BROXQ5VW32 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms