Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIF1Q5UIP0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms