Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms