Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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