Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHSL1Q5SYE7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms