Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEP170Q5SW79 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms