Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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ZBED5Q49AG3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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ZBED5Q49AG3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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ZBED5Q49AG3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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ZBED5Q49AG3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED5Q49AG3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms