Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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