Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms