Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms