Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYSND1Q2T9J0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms