Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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HIST2H2BEQ16778 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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HIST2H2BEQ16778 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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HIST2H2BEQ16778 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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HIST2H2BEQ16778 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HIST2H2BEQ16778 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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