Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms