Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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