Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms