Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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