Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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