Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-1Q15270 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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