Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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