Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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