Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAT1Q14517 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FAT1Q14517 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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FAT1Q14517 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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