Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF1Q14162 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF1Q14162 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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